论文保密协议是指作者与读者、指导教师、评审专家等签署的保密协议，规定论文的内容、数据、研究方法等不得向外公开或泄露的法律文件。论文保密协议的必要性和作用如下：
保护作者的研究成果和知识产权。在完成学术研究时，作者所涉及的数据、方法、结论等均属于知识产权范畴，保密协议可以确保这些知识产权不被未经授权的人使用或抄袭，从而保障作者的权益。
保证学术研究的公正性和客观性。保密协议可以避免有利益冲突的利益相关方干扰研究，确保学术研究的客观性和公正性。
保障机构的商业利益。保密协议可以防止商业机构的竞争对手获得机构的商业机密和研究成果，从而保护机构的商业利益。
维护学术规范和伦理。保密协议可以确保作者、读者、指导教师、评审专家等各方在学术研究中遵守伦理规范和学术规范，不得泄露机密信息或利用机密信息谋取私利。
总之，论文保密协议是保护学术研究的合法权益、维护学术规范和伦理、保护机构的商业利益的重要手段，具有重要的必要性和作用。